尿液细菌学检查对确诊泌尿系感染、鉴定病原、选择药物和观察疗效都很重要。因此，要特别注意尿标本收集过程的无菌操作，同时也要防止防腐剂及外阴消毒剂混入尿标本而抑制细菌生长，影响细菌培养阳性检出率。

革兰阴性菌（大肠埃希菌、变形杆菌、肺炎克雷伯菌、淋病奈瑟菌、产气肠杆菌、沙门菌、沙雷菌等）和革兰阳性菌（金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肠球菌等）。

用于一般细菌检查，以无菌方法取尿沉渣涂成薄膜片，自然干燥或火焰微热固定，革兰染色镜检，根据染色和细菌形态特点可以明确革兰阳性/阴性，球菌/杆菌。

一般细菌培养需分别接种在血平板和中国蓝平板上，同时接种肉汤培养基1支，经培养48小时才能出报告。

有倾注平板法和定量接种法。对结果的判定标准是：若同一份标本中检测到3种以上不同种微生物则认为是污染，但有10%的尿路感染者，可能在一份标本中分离到两种病原菌。尿标本中革兰阴性杆菌菌落计数＞10 ⁵CFU/ml，革兰阳性球菌菌落计数＞10 ⁴CFU/ml，才有诊断意义。