令一项指标表现最好或达到设定上限的高校在该项指标上得1分，其它高校按其与最大值或上限值的比例得分。按照模块加权汇总指标得分后得到高校在各个评价模块的得分，各个模块得分累加后得到高校的总得分。
为避免异常数据对得分计算的影响，一项指标的上限值设置为所有双高计划建设高校在该项指标上的最大值，超过上限值的高校得满分。此外，当某项指标的数据分布差异过大，第二名高校的数据不高于上限值的50%时，将第二名高校的数据作为上限值，超过上限值的高校得满分。
