显微镜检查法对有症状的男性急性淋菌性尿道炎患者的敏感性和特异性可高达95%～99%。综合多项评估试验结果，该方法对于男性尿道炎患者的检测效果与培养法相似，敏感性可以达到89%～94%，特异性可以达到94%～97%，但对男男性行为直肠炎患者的肛拭子，敏感性仅为54%。该方法应用于女性患者的样本敏感性较低，研究显示宫颈标本检出率仅为50.3%，尿道标本检出率仅为51.9%。因此，显微镜镜检对于有症状的男性尿道拭子样本具有诊断价值，不推荐使用镜检法对其他部位的标本进行检测。

培养法是诊断淋病的“金标准”方法，有较高的敏感性和特异性。在女性淋菌性宫颈炎和尿道炎中，其检测阳性率分别达到93.6%和94.8%。但研究发现淋球菌培养的敏感性受多种因素影响（72%～95%）。对于无症状性感染，培养的敏感性会下降至65%～85%。对于泌尿生殖道以外的样本，培养法的敏感性进一步降低，例如对咽拭子和直肠拭子，敏感性分别降至36%和75%。当标本需长时间运输时，其检测阳性率可能会下降16%。此外，T-M培养基中所含的万古霉素可能抑制部分万古霉素敏感淋球菌的生长。

核酸检测具有很高的敏感性（可高达100%）和特异性（可高达99.8%），并适用于多种类型样本的检测，特别是非侵入性取材标本，如尿液标本、阴道标本。女性阴道拭子可以自我取材，且和宫颈拭子检测的敏感性和特异性无统计学差异，所以临床上优先推荐核酸检测。核酸检测对于泌尿生殖道以外部位（如直肠）淋球菌感染的敏感性较高（75%～91%），且显著高于培养法，虽然目前还没有获得批准的用于口咽部或直肠拭子的淋球菌商品化核酸检测试剂盒，但在诊断直肠和咽部淋球菌感染时优先推荐采用核酸检测方法。

抗原检测是基于抗原抗体结合的一种快速检测方法，鉴于目前尚无理想检测效能的抗原检测方法，临床上暂不推荐使用此方法检测淋球菌感染。如临床使用抗原检测，结果为阳性的标本需进一步采用培养法或核酸检测法复检。