脑出血患者发生血栓栓塞性疾病的风险很高。在女性和非洲裔美国人中该风险似乎更高。一项随机试验表明，弹力袜与间歇性空气压缩装置联合应用在降低脑出血后无症状深静脉血栓（DVT）发生率方面的效果优于单用弹力袜（4.7%对15.9%）。单用梯度压缩弹力袜对预防DVT无效。然而，尚不清楚在应用空气压缩装置基础上进行抗凝治疗的效果。2项小样本随机试验显示，在脑出血发病后第4天或第10天开始皮下注射小剂量肝素的患者中，未能发现DVT发生率存在差异，也未发现出血风险增高。一项在脑出血发病后第2天开始抗凝治疗的非对照研究表明，血栓栓塞性疾病减少，而再出血未增加。

故而美国心脏协会／美国卒中协会发布的《自发性脑出血治疗指南》推荐：脑出血患者应在弹力袜基础上使用间歇性空气压缩装置，以预防DVT。在证实出血停止之后，卧床的脑出血患者在发病1～4日后可考虑皮下注射小剂量低分子肝素或普通肝素，以预防静脉血栓栓塞。