古人根据灵芝子实体的颜色将灵芝分为“六芝”，按照现代生物学分类，设想用灵芝科的所有品种来容纳“六芝”，使它们能一一对应起来，这是非常难的，甚至是不可能的。迄今为止，相对能确定的只有赤芝、紫芝。
中国科学院微生物研究所赵继鼎教授，曾根据《本草纲目》中对“六芝”的记载与现代生物学分类方法的有关种作了对比分析，现归纳介绍如下：
