疾病预后与分流量的大小、并发症的严重程度以及合并其他畸形的情况有关。心内分流的持续存在会增加罹患感染性心内膜炎的风险。长期随访显示，部分小缺损可以自行闭合。有学者在术中发现，实际上是发生了动脉瘤样变的三尖瓣隔瓣封闭了缺损。没有自行闭合的可行手术封堵，结果较为满意。有学者建议，即使是无症状的患者也应进行手术封闭缺损，以预防感染性心内膜炎的发生。