（一）水文水资源与水利工程科学国家重点实验室

2004年10月经科技部批准，依托南科院与河海大学组建，2007年6月通过验收。2008年和2013年通过了科技部组织的工程与材料领域国家重点实验室评估，其中2013年被评为优秀类国家重点实验室。实验室实行建设管理委员会领导和学术委员会指导下的主任负责制，现有固定研究人员72人，其中具有正高职称44人，具有博士学位66人。

总体定位：突出应用基础研究和关键技术创新，在解决我国水问题及重大工程问题中发挥重要作用，成为解决我国水文水资源与水利工程领域关键科学技术问题的创新平台和培养高层次人才的基地。现有5个主要研究方向：水资源演变机理与高效利用、水旱灾害形成机理及防灾减灾、水生态与水环境演变规律及保护、河口海岸综合治理与保护、水工程安全与新材料。