混合加密同时使用了对称加密和非对称加密，对称加密的一个很大问题是通信双方如何将密钥传输给对方，为了安全，一般采用带外传输。也就是说，如果加密通信是在网络中进行的，那么密钥的传输就需要通过其他途径，如邮件、短信等，即使如此也很难保证密钥传输的安全性。非对称加密的最大优点是事先不需要传输密钥，但是加解密速度慢，因此在实际应用中，通常采用混合加密，首先通过非对称加密交换对称加密所需的密钥，然后在后续的通信中，双方使用交换后的密钥对消息进行加密和解密。
