Hopsu-Havu和Glenner在鼠肝脏组织匀浆过程中发现了DPP-4，在2003年首次明确了DPP-4蛋白质的三维结构。DPP-4是一种位于细胞表面的丝氨酸肽酶，广泛存在于血浆、胃、肠道、肾脏、淋巴结和结缔组织等体内组织中，其中肾脏最多。其家族成员包括DPP-1、DPP-2、DPP-3、DPP-4、DPP-8、DPP-9和成纤维细胞活化蛋白-α（FAP-α）。DPP-4的分子量为220ku，活性体为二聚体形式，每个亚单位包含两个结构域，控制底物的出入口位于两个结构域之间的一个大小为30～45A的大型洞穴，其内的袋状结构便是DPP-4的活性部位，凡是结构的N端第二位上是脯氨酸（Pro）或丙氨酸（Ala）的多肽都是DPP-4发挥活性的主要底物。