DNA测序技术经历了从复杂的手动操作到高通量的自动化设备的快速发展过程，最初复杂的化学法测序已经被先进的电子技术完全替代，而新一代的测序技术如单分子测序技术的上市也指日可待。随着技术的进步，全基因组测序已经从复杂的、价格昂贵的科学研究技术转变为能够用于分析研究临床面临的实际问题的有效工具。

1998年，Cole等阐明了第一株分枝杆菌－结核分枝杆菌H37Rv的全基因组序列，这是分枝杆菌研究领域的一个里程碑，对于深化结核病领域的基础研究、开发新型的结核病的治疗和预防措施有深远影响。而之后的十几年，新技术大发展带来的价格降低和研究周期缩短，使得全基因组测序用于结核病相关的多个问题的阐述，已经公开发布的结核分枝杆菌全基因组序列已经达到上千株，相信随着技术的普及，会有大量的全基因组序列得以公布。