自身免疫（autoimmunity）是指机体免疫系统对自身抗原发生免疫应答，产生自身抗体和（或）自身致敏淋巴细胞的现象。通常高等动物的免疫系统具有高度分辨“自己”与“非己”抗原物质的能力，在一般情况下，机体对“非己”抗原发生免疫排斥，而对自身抗原呈现免疫耐受。

自身免疫性疾病（autoimmune disease）是机体对自身成分发生免疫应答而导致的疾病状态。机体不仅能作出清除外来抗原的应答反应，在对自身细胞或组织抗原发生免疫应答时，机体的免疫系统不能或不易清除自身的细胞或细胞间的抗原成分，却是持续不断地对其进行免疫攻击，结果引起自身免疫性疾病。自身免疫性疾病有下述特点：①患者体内可检测到自身抗体（autoimmune antibody）和（或）自身反应性T淋巴细胞（autoreactive T lymphocytes）；②自身抗体和（或）自身反应性T淋巴细胞介导对自身细胞或组织成分的获得性免疫应答，造成损伤或功能障碍；③病情的转归与自身免疫反应强度密切相关；④反复发作，病情迁延。

一些病原体，如HCV等，可通过多克隆激活和分子模拟等机制引起自身免疫性疾病，本章节综述了目前HCV诱发自身免疫的假说。