出版航海日志
众人又花了二十二个月才回到英格兰,而且在这段时间,指挥官之间的关系恶化。他们彼此争斗,抢夺着“化身”号的指挥权,因为后来发现,这艘装着满满的丝绸、香料、珠宝、银子和其他奇珍异宝的船,价值超过十万英镑。不可思议的是,科特尼与库克愿意让多佛医生指挥这艘船。依旧疼痛难耐的罗杰斯召集其他指挥官,挡下这个任命,宣称多佛“完全缺乏担任这个职位的能力”。在接下来的“纸笔战”中,指挥官们同意让步。塞尔科克与其他人是实际操作“化身”号的人,而多佛则拥有主船长(Chief Captain)这个仪式性的头衔。这场冲突之后,罗杰斯树立了一些心怀仇恨的敌人。
一七一〇年六月底,众人抵达荷兰东印度(Dutch East Indies)首都巴达维亚(Batavia,就是现今的印度尼西亚雅加达),这是一年半以来,他们第一次抵达友好的港口。众人清理了“公爵”号、“公爵夫人”号、“化身”号越来越糟的船身,并用报废价格卖掉如今满是蛀虫的“恩典港”号。多佛派的科特尼与其他几个指挥官,接下来会宣称“公爵”号依旧严重漏水,需要更换新龙骨,并指控罗杰斯拒绝解决这个问题。他们还怀疑罗杰斯怀着航向纽芬兰或巴西的“秘密阴谋”,想要走私东印度货物。这是一项严重的指控,因为英国东印度公司(British East India Company)拥有全英国与东南亚交易的合法垄断权。他们表示,与强大的东印度公司做对,“可能危及”这趟远征。许多船员开始相信罗杰斯偷走了大量金银珠宝,并藏在巴达维亚,尽管这件事似乎不太可能发生,而且也不符合罗杰斯的性格。我们确实知道的是,罗杰斯在巴达维亚待了六个月,其间动了手术治疗脚后跟,移除上口腔的火枪子弹。此外,他也密切监督采购返乡必需品,避免和东印度公司有任何瓜葛。但即使有这些预防措施,也无法帮助布里斯托尔人,让他们免于东印度公司董事无法满足的贪欲。
一七一一年十月十四日,这三艘船终于在泰晤士河下锚时,东印度公司的代表正等着它们,宣称这几艘私掠船在巴达维亚购买必需品时,侵害了东印度公司的垄断权。他们扣押已因伦敦报纸而出名的大“阿卡普尔科船”,并让私掠船船主卷入冗长的官司诉讼。最后,十四万七千九百七十五英镑的收益中有六千多英镑付给了东印度公司董事。费用被扣除后,每个船主都拿走双倍于投资的钱。罗杰斯脸毁容、脚重伤、弟弟死了,最后大约拿到一千六百英镑,而且其中的大部分大概都拿去付了家人在布里斯托尔欠下的债。许多船员则一毛钱都没拿到,“公爵”号与“公爵夫人”号一抵达伦敦,他们就被皇家海军的强征队抓上船。
罗杰斯回到布里斯托尔妻儿身边疗伤,准备出版自己的日志。他的环球之旅与成功拿下马尼拉大帆船的事迹,让他成为全国性的英雄,却也让他残废、遭受冤屈,而且跟三年前离家时相比,也没有增加多少财富。